Afincado en la confluencia de los ríos Ródano y Saona, el museo abrió sus puertas a finales de 2014. La estructura, concebida por la agencia austriaca Coop Himmelb(l)au como una metáfora del conocimiento, está formada por un "cristal" de vidrio (el mundo conocido) envuelto en una "nube" de acero inoxidable (lo desconocido y la exploración). Mezcla de museo de las Ciencias, del Hombre y de Artes y Oficios, el museo se centra en la Tierra desde sus orígenes, en la evolución de la humanidad y en la estructuración de las sociedades gracias a unas colecciones procedentes de los principales museos franceses.