Este pequeño edificio integrado en la iglesia y con entrada por un claustro del s. XIV es una de las realizaciones más exquisitas de las que se atribuyen a Brunelleschi, que lo construyó para los Pazzi, grandes rivales de los Médicis. El artista trabajó en él hasta 1445, aunque la capilla no fue acabada hasta aproximadamente 1460, mucho después de su muerte, acaecida en 1446. Brunelleschi elevó a la perfección su ideal arquitectónico, plasmado ya en San Lorenzo. El claustro da acceso al museo de la Obra Santa Croce.