Encaramada sobre un risco que emerge del mar, la ciudad alta de Bonifacio está dividida en dos sectores: la ciudad antigua medieval y la ciudadela. Mandada construir por Napoleón III, la carreta de acceso rodea el baluarte del Estandarte dominando toda la bocana de Bonifacio. A las estrechas calles que rodean la iglesia de Santa María la Mayor se asoman casas de bastante altura unidas por unos curiosos arbotantes (en realidad se trata de canalizaciones para llevar las aguas pluviales a las cisternas). Desde el mar, la ciudad alta resulta realmente impresionante.